作者
钱 程,孔婧欣,王 洋,李玉卿
文章摘要
目的:基于生信分析,研究紫苏叶活性成分对肝癌细胞中关键基因表达的影响。方法:选用人肝癌细胞LM3、紫苏叶活性成分提取物、细胞培养基、生化分析试剂(RT-qPCR试剂盒、Western blot试剂)等实验材料,设计对照实验。对照组使用不含紫苏叶活性成分提取物的培养基培养肝癌细胞;实验组在培养基中添加一定浓度的紫苏叶活性成分提取物,培养肝癌细胞。利用GeneCards数据库筛选出肝癌的相关作用靶点。利用注释可视化和集成发现数据库(Database for Annotation Visualization and Integrated Discovery,DAVID)对靶点基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encycopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。最后通过紫苏叶活性成分提取物干预人肝癌细胞LM3实验初步验证相关通路中核心靶点,在光镜下观察细胞形态,用细胞增殖及毒性检测试剂盒(cell counting Kit-8,CCK8)检测细胞存活率,采用实时荧光定量聚合酶链反应(real time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)法和WB法分析靶点基因的表达量。结果:实验组细胞凋亡率显著高于对照组,P<0.05;实验组差异基因在细胞周期调控通路中的富集程度显著高于对照组,P<0.05。结论:通过生物信息学和细胞实验结果表明:紫苏叶活性成分可以通过调节关键基因的表达来抑制肝癌细胞生长,值得推广。
文章关键词
生信分析;肝癌关键基因;紫苏叶活性成分;关联
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